甲基化胞嘧啶（5

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甲基化胞嘧啶（5

核酸修饰的表观遗传学在后基因时代一直是生命科学的研究热我的黑色小礼服点。自从N6-甲基化腺出口许可证苷在mRNA发现以来，截止目前发现大约有160中修饰核苷（修饰核苷酸），甲基化可发现在不同类型的RNA中，并且具有物种专属性。其中5-甲基胞嘧啶（m5C）已在多种生物的mRNA、rRNA、tRNA中被发现。m5C在RNA具有可逆性，修饰后的RNA对于不同的生物过程影响重大，包括RNA稳定性、蛋白合成、转录调控。

随着高通量基因测序技术的发展和液相色谱检测灵敏度的提升，检测RNA甲基化的整体水平有了很大的发展。

RNA的整体甲基化水平可用LC-MS/MS液质串联色谱来检测，LC-MS/MS可以获得分子和碎片离子峰，可以对碱基记性定性和定量的分析。Bisulfite sequencing技术可以用来分析不同区域的甲基化，该技术手段表面m5C是一种丰度较高的mNRA修饰。

m5C修饰主要有3类蛋白质介导，分别是甲基化转移酶（methyltransferases）、去甲基化酶（demethylases女蜗）、结合蛋白（binding proteins）。

m5C在mRNA中除了调节mRNA的稳定性外，其他功能探索仍然不全面和深入，需要进一步努力来揭示。

新发现的证据表明甲基化状态与chulian癌症的发病机制密切相关，包括起始、转移、进展以及耐药性和复发。1）mRNA、miRNA 和 lncRNA 中的异常 m 5 C 沉积促进癌症血管生成和转移；2）在肺癌患者的循环肿瘤细胞中可以检测到RNA m 5 C水平升高；3）NSUN2 基因在胃肠道癌症中的突变率最高，几乎所有低生存率的患者都与m5C 调节因子的高表达显着相关；4）m 5 C 促进了人膀胱尿路上皮癌的发病。

常用缩略词

m6A:

N6-methyladenosine

m5C:

5-methylcytosine

UTRs:

Untranslated regions

tRNA:

Transfer RNA

rRNA:

Ri托福机经bosomal RNA

mRNA:

Messenger RNA

snRNA:

Small nuclear RNA

miRNA:

Micro RNA

lncRNA:

Long non-coding RNA

eRNA:

Enhancer RNA

5hmC:

5-hydroxymethylcytosine

5fC:

5-fo黄淮学院怎么样rmylcytosine

5caC:

5-carboxycytosine

DNMT:

DNA methyltransfer犀牛角杯ase

LC-MS:

Liquid chromatography-mass spectrometry

CDS:

Coding sequence

RCMTs:

RNA:m5C met通道抠图hyltransferases

TRDMT:

TRNA-specific met套白狼hyltransferase

TET:

Ten-eleven translocation

ALKBH1:

Alpha-ketoglutarate-dependent dioxy量筒的使用genase ABH1

hm5cm34:

5-hydroxymethyl-20-o-methylcytidine

f5cm34:

5-formyl-20-o-methylcytidine

R七夕图IP:

RNA immunoprecipitation

GSCs:

Germline stem 五福金牛cells

CSD:

C齐齐哈尔大学学报old-shock domain

VL:

V-loop

TSL:

T-stem and loop

XIST:

X-inactive specific tran树化玉scripts

PRC2:

Polycomb repressing complex 2

CNV:

Copy number variation

GSEA:

Enrichment analysis

TFs:

Transcription fact外贸软件ors

5-AZA:

5-azacytidine

FDA:

Food and Drug Administration

MDS:

Myelodysplastic syndrome

AML:

Acute myelogenous leukemia

SGC:

Structural G九寨沟住宿enome Consortium

SAM:

S-adenosylmethionine

5’FU:

5-fluorouracil

GSC:

Germline stem cell

S1P:

Phingosine-1-phosphate

SPHK:

Sphingosine kinase

BC:

Breast cancer

PCa:

Prostate cancer

TLR:

Toll-like receptor

SLE:

Systemic lupus erythematosus

CR:

Coding region

HNSCC:

Head and neck squamous cell carcinoma

CTLA4:

Cytotoxic T lymphocyte antigen 4

PD-1:

Programmed cell death 1

ICAM美国经典电影-1:

Intercellular adhesion molecule 1

PD-L1:

Programmed death-1 ligand 1

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本文标签： 胞嘧啶甲基化